Jacques Brun, pilote français qui survole l’Italie en avion, remarque au sol, près de Florence, de curieux dessins : il s’agit des vestiges d’un labyrinthe. Intrigué, il retourne sur place en voiture et finit par mettre à jour de très anciens documents, oubliés dans une bibliothèque. Il découvre que le labyrinthe fut au XVIe siècle le théâtre d’un drame inexpliqué. Giulio et Zaccharia, deux jeunes Florentins pourchassés pour hérésie par l’Inquisition, y entraînèrent leurs poursuivants et les y firent disparaître à jamais. Jacques Brun retrouve aussi un curieux cahier dans lequel Giulio avait transcrit son histoire avec Zaccharia dans l’espoir qu’un jour le secret du labyrinthe puisse être dévoilé. À travers les divergences qui les opposent à l’Église et les discussions de Zaccharia, versée dans les sciences occultes, avec Giulio, passionné par les travaux de Copernic, ce sont trois conceptions du monde qui s’affrontent : la religion, l’ésotérisme et la science naissante. Débat qui n’est peut-être pas encore tranché aujourd’hui, mais qui conduira les. deux jeunes amants florentins vers leur tragique destin.